Sub domnia lui Iustinian bazilica cu cupola avea sa triumfe prin construirea celor doua biserici invecinate, Sfanta Irina si Sfanta Sofia, ridicate spre a inlocui sanctuarele asezate sub aceleasi hramuri, distruse la 15 ianuarie 532 de incendiul din cursul rascoalei Nika (numita astfel pentru ca razvratitii se raspandisera pe ulite strigand Nika: invinge !). In afara de existenta unei cupole, nu cunoastem aspectul pe care il aveau in secolul al Vl-lea partile superioare ale bisericii Sfanta Irina, deoarece edificiul, dupa ce trecuse printr-un nou incendiu in 564, a fost grav deteriorat de un violent cutremur de pamant, in octombrie 740, si reconstruit sub Constantin al V-lea Copronimul.